V súvislosti so zmenami v elektronickom doručovaní podaní daňovým subjektom podľa zákona č. 563/2009 Z. z. o správe daní (daňový poriadok) a o zmene a doplnení niektorých zákonov v znení neskorších predpisov, je dôležité pochopiť proces uzatvárania dohôd o elektronickom doručovaní medzi daňovým subjektom a daňovým úradom.
Elektronické doručovanie podľa zákona SNR č. 511/1992 Zb.
Pred nadobudnutím účinnosti nového daňového poriadku, podľa zákona SNR č. 511/1992 Zb. o správe daní a poplatkov, bolo možné doručovať podania elektronickými prostriedkami na adresu elektronickej podateľne správcu dane. Tieto podania museli byť podpísané zaručeným elektronickým podpisom. Ak daňový subjekt chcel doručovať písomnosti bez zaručeného elektronického podpisu, musel písomne oznámiť správcovi dane potrebné údaje a uzavrieť s ním písomnú dohodu. Táto dohoda sa riadila primerane ustanoveniami citovaného zákona.
Dohoda podľa § 20 ods. 8 zákona SNR č. 511/1992 Zb. v znení neskorších predpisov o spôsobe doručovania písomností elektronickými prostriedkami, ktoré nebudú podpísané zaručeným elektronickým podpisom, sa uzatvárala medzi daňovým subjektom a daňovým úradom. V prípade registrácie daňového subjektu alebo poverenej osoby pre autorizované elektronické služby, existovala možnosť vytvorenia väzby aj pre ďalšie osoby, napríklad zamestnancov daňového subjektu, po ich registrácii podľa Používateľskej príručky pre autorizované elektronické služby.
Nevyhnutnou podmienkou pri vytváraní väzby inej osoby k daňovému subjektu bola znalosť ID - čísla prideleného pri registrácii a Osobného identifikačného kódu - kódu zvoleného osobou pri registrácii. Dohody, ktoré daňové subjekty uzatvorili, obsahovali spôsob preukazovania doručenia písomností a spôsob overovania podania urobeného elektronickými prostriedkami. Ak dohoda určovala, že správca dane overí zhodu s prvou stranou doručenej písomnosti a písomným „Vyhlásením o podaní písomnosti elektronickou formou“, daňový subjekt bol povinný takto postupovať.
To znamenalo, že daňový subjekt bol povinný preukázať podanie písomnosti doručovanej elektronickými prostriedkami (bez zaručeného elektronického podpisu) do piatich pracovných dní od jej podania doručiť správcovi dane prvú stranu doručenej písomnosti a písomné „Vyhlásenie o podaní písomnosti elektronickou formou“ podľa vzoru zverejneného na internetovej stránke Daňového riaditeľstva SR. Ak sa tak nestalo, písomnosť sa považovala za nepodstatnú.
V prípade prekážok na strane daňového subjektu, ktoré mu bránili v doručení písomností elektronicky v stanovenej lehote, bol povinný doručiť ich iným vhodným spôsobom v zákonom stanovenej lehote. Daňový subjekt mohol poveriť oprávnenú osobu na elektronické doručovanie písomností, pričom zodpovedal za jej konanie a bol povinný ju preukázateľne poučiť o povinnostiach ochrany autentifikačných údajov a dodržiavania zásad bezpečnosti.
Dohoda zanikala písomnou dohodou zúčastnených strán, pričom každá strana mohla dohodu písomne vypovedať z akéhokoľvek dôvodu alebo bez udania dôvodu. Príkladom bola dohoda uzatvorená 27. 5. 2011 so správcom dane o doručovaní písomností elektronickými prostriedkami bez zaručeného elektronického podpisu, ktorá mala byť platná až do jej vypovedania.

Elektronické doručovanie podľa zákona č. 563/2009 Z. z. (Daňový poriadok)
Zákon č. 563/2009 Z. z. o správe daní (daňový poriadok) priniesol zmeny s cieľom zabezpečiť rýchlejšiu elektronickú komunikáciu daňového subjektu so správcom dane. Od 1. 1. 2012 mohol daňový subjekt doručovať písomnosti elektronickými prostriedkami prostredníctvom elektronickej podateľne ústredného portálu verejnej správy alebo na elektronickú podateľňu prevádzkovanú Finančným riaditeľstvom SR, pričom tieto podania museli byť podpísané zaručeným elektronickým podpisom.
Daňový poriadok však umožnil aj doručovanie elektronickými prostriedkami bez zaručeného elektronického podpisu, a to na základe písomnej dohody o elektronickom doručovaní uzatvorenej so správcom dane. V takom prípade daňový subjekt oznámil správcovi dane potrebné údaje na tlačive podľa vzoru uverejneného na webovom sídle Finančného riaditeľstva SR. Dohoda obsahovala náležitosti elektronického doručovania, spôsob overovania elektronického podania a spôsob preukazovania doručenia.
Finančné riaditeľstvo SR sprístupnilo od januára 2012 novú bezplatnú formu elektronickej komunikácie, ktorá bola v súlade s novelami daňového poriadku. Táto možnosť umožnila daňovým subjektom plnohodnotne elektronicky komunikovať s finančnou správou aj bez potreby zakúpenia zaručeného elektronického podpisu. Toto ustanovenie nadobudlo účinnosť 1. 4. 2012 a vzťahovalo sa na všetky podania.
Výnimku tvorili prílohy podania, ktoré bolo možné doručovať aj inak ako elektronickými prostriedkami. Lehota pre daňový subjekt bola zachovaná, ak bol v posledný deň lehoty vykonaný úkon u správcu dane alebo podanie odovzdané na poštovú prepravu, alebo prijaté elektronickými prostriedkami na adresu elektronickej podateľne.
Dohoda o elektronickom doručovaní, ktorú mal daňový subjekt nájsť na webovom sídle Finančného riaditeľstva SR, sa predkladala správcovi dane vo dvoch exemplároch. Ustanovenie § 14 daňového poriadku nadobudlo účinnosť 1. 4. 2012, od kedy boli daňové subjekty povinné doručovať podania elektronickými prostriedkami. Vzhľadom na to sa predpokladal zvýšený záujem daňových subjektov o uzatváranie dohôd.
Dohoda o elektronickom doručovaní uzatvorená podľa § 13 ods. 5 zákona č. 563/2009 Z. z. v znení neskorších predpisov upravovala náležitosti elektronického doručovania, spôsob overovania a preukazovania elektronického doručovania. Nadobúdala platnosť a účinnosť dňom jej podpísania oboma účastníkmi (najskôr 1. 1. 2012) a zanikala písomnou dohodou alebo výpoveďou ktorejkoľvek zo zúčastnených strán.

Proces registrácie a autorizácie
Registrácia používateľa je proces, pri ktorom sa fyzická osoba stáva používateľom elektronických služieb finančnej správy SR a je jej pridelený identifikátor používateľa (ID). Okrem toho je potrebné zadať aj heslo a osobný identifikačný kód. Používateľ potvrdí registračný formulár, čím sa registruje a výsledkom je pridelenie ID používateľa. Tento registračný formulár sa predkladá správcovi dane pri autorizácii. Autorizácia je proces, pri ktorom sú registrovanému používateľovi pridelené prístupové práva k dátam daňového subjektu a realizuje sa na colnom alebo daňovom úrade.
Pri autorizácii je potrebné predložiť osobný identifikačný doklad. Za daňový subjekt je oprávnený podpisovať podania určené správcovi dane jeho poverený zamestnanec na základe poverenia, pričom nie je potrebné doručovať plnomocenstvo, ale poverený zamestnanec sa musí preukázať poverením.
Daňový subjekt, ktorý je platiteľom DPH, má povinnosť doručovať podania od 01.01.2014 elektronicky. Podanie podané písomne (v listinnej podobe) nezakladá právne účinky a správca dane vyzve daňový subjekt na odstránenie nedostatkov.
Písomnú dohodu o elektronickom doručovaní uzatvára od 1.1.2018 už len fyzická osoba alebo poverená osoba (splnomocnený zástupca alebo poverený zamestnanec). Dohoda musí byť podpísaná oprávnenou osobou pred správcom dane alebo s úradne overeným podpisom.
